- Un Director General y un Director Adjunto
- Un Servicio de Operaciones (Subdividido en 6 Unidades o Departamentos)
- Un Servicio de Administración y Apoyo General
- Un Servicio de Informática
- Diversas Delegaciones Regionales: en Oporto, el Algarve, Madeira y las Azores.
En 2009 tenía un presupuesto de 11,9 millones de euros unos 820.000 estaban destinados a gastos reservados, se estima que el SIS cuenta con cerca de 800 efectivos de los cuales el 50% pertenecerían al Servicio de Operaciones y Apoyo, el personal se encuadra en alguna de las siguientes categorías:
- Técnico superior (técnicos coordenadores de informações e técnicos superiores de informações),
- Técnico (técnicos de informações),
- Técnico-Profesional (técnicos-adjuntos de informações),
- Técnico Profesional de Apoyo General
- Técnico de Seguridad (vigilantes).
El SIS contaba con un edificio en Lisboa donde trabajaban cerca de 120 efectivos, en Febrero de 2010 y con un coste de 15 millones de euros se inauguro la nueva sede del SIS en el Forte da Ameixoeira en la periferia de Lisboa, dotado con la última tecnología y en cuyos subterráneos se han habilitado varias salas con protección frente a TEMPEST para hacer frente a escuchas electrónicas, en el complejo también se ubica:
- El Gabinete del Secretario General del SIRP
- La Escola Nacional de Informações (ENI)
- Los Servicios Comunes del SIRP.