En 2014 se crea dentro del Estado Mayor de la Defensa el Mando de Operaciones como:
- Órgano responsable del planeamiento operativo, la conducción y el seguimiento de las operaciones militares.
- Asesora al Jefe de Estado Mayor de la Defensa en la conducción estratégica de las operaciones y es responsable de realizar el planeamiento y conducción de aquellos ejercicios que se determinen.
- Dependiendo del Mando de Operaciones se constituye permanentemente el Mando Conjunto de Operaciones Especiales.
Dentro de su Área de Operaciones, se encuentra la Sección de Inteligencia J2, que es la encargada de asesorar, planificar y auxiliar en materia de inteligencia y contrainteligencia.
Dentro del Mando Conjunto de Operaciones Especiales (MCOE), también se encuentra una Sección de Inteligencia que opera como Centro de Integración y Difusión de la Inteligencia (CIDI).
Dentro de cada rama de las Fuerzas Armadas, existen 2 unidades, una de ellas dedicada a la Inteligencia y la otra a funciones de Contrainteligencia y Seguridad, recordando en cualquier caso que las labores de inteligencia las centraliza el Centro de Inteligencia de las Fuerzas Armadas (CIFAS):
Ejercito de Tierra
- Sección de Inteligencia y Seguridad de la División de Operaciones del Estado Mayor del Ejército
- Centro de Seguridad del Ejercito de Tierra (CESEGET)
La Armada
- Sección de Inteligencia de la División de Operaciones del Estado Mayor de la Armada
- Sección de Seguridad Naval Central (SSN)
Ejercito del Aire
- Sección de Inteligencia de la División de Operaciones del Ejercito del Aire
- Sección de Información Interna